近年来，湖南农业综合开发工作在资金管理方面始终坚持科学理财，精细管理，并取得了明显成效。1989-2008年全省累计完成农业综合开发财政投资83.8亿元，共改造中低产田2155.87万亩，增产粮食41.17亿公斤，扶持农业产业化经营项目810个，为推进现代农业和新农村建设作出了重要贡献。
　　积极筹措资金，扩大投入规模。一方面，将配套资金纳入预算管理；另一方面，从国有土地出让金收入中安排部分资金用于配套，并通过财政资金引导社会资金投入。2006-2008年，全省农业综合开发累计吸引农村集体、农民群众自筹资金及其他资金21.52亿元，吸引银行贷款投入6.3亿元。2008年全省农业综合开发中央财政投资6.01亿元。
　　合理分配资金，确保安全高效。在农业综合开发资金分配上，湖南始终坚持确保有限的资金用在“刀刃”上。在建立了多层次、全方位的项目资金管理架构的同时，坚持并不断完善以“综合因素法”为主分配财政资金。将财政投资按照基础资源、工作质量等因素进行分配，确保客观公正，既突出了提高粮食综合生产能力的主题，又达到了奖优罚劣的目的。
　　强化全程管理，突出“精细”二字。一是大力推行招投标制。规定施工单项合同估算价在100万元以上的，重要设备、材料等物资采购单项合同估算价在50万元以上的，勘测、设计、监理等服务单项合同估算价在30万元以上的，必须实行公开招标。低于上述限额标准的，采取邀请招标、竞争性谈判、询价等方式组织实施。二是认真实行工程监理制。建立了政府监督、专业监理、群众参与的“三位一体”工程质量控制机制。三是严格报账程序。实行统一报账管理机构、统一报账流程、统一报账单据、统一有偿资金放款手续、统一会计核算。
　　规范操作程序，实行“阳光开发”。一是规范项目立项程序。明确规定每个项目必须逐级申报、实地考察、专家评审、择优筛选。对土地治理项目充分征求农民意见，项目立项必须有三分之二以上农户签字。二是把握项目立项条件。把自筹资金和配套资金落实情况作为项目立项与否的重要依据。三是严格执行公示制度。让项目区广大农民了解掌握资金使用的具体情况，自觉接受群众监督。
　　科学整合资金，力求规模效益。从2005年开始，湖南省在祁阳县和赫山区创办了2个规模开发示范点，按照“综合、整合、结合”的工作要求，将农业综合开发资金与土地整理、小型水利、通乡通村公路、沼气、农业科技推广等方面的支农资金统筹安排、捆绑使用、集中投入、规模开发。经过4年建设，项目区不仅农业综合生产能力明显提高，而且整个面貌有了很大改变。
　　坚持依法理财，推进依法开发。2006年出台了《湖南省农业综合开发条例》，并制发了一系列具体管理办法和制度。加强人员业务培训，强化监督检查，严格按规定落实处罚措施，不断提高理财效能。

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