海洋岛国家级水产种质资源保护区位于海洋岛渔场中心带长海县海洋岛后大套海域,总面积为500公顷,其中核心区面积为200公顷,实验区面积300公顷,主要保护对象为栉孔扇贝、刺参、皱纹盘鲍、大连紫海胆,其他保护物种为黄海胆、香螺、栉江珧、紫石房蛤等。
目前,除海洋岛外,我市还有三山岛也已被列为国家级水产种质资源保护区。主要保护对象为皱纹盘鲍、刺参、光棘球海胆、香螺、脉红螺、栉孔扇贝、栉江珧、紫石房蛤等。