鱼卵、幼苗的敌害细小,常常因过滤的时间推移而数量越聚越多,并富集在过滤窗布之外,阻塞水流,使过滤布性能明显下降,加上布的内外滋生寄生性藻类或其他水生动、植物并再附上泥粒,滤水十分困难,不能满足催产、孵化需要,并有可能压破过滤布,又不易发现,致使敌害趁机而入,危害鱼卵、幼苗,即使定期洗刷过滤窗布,也不能从根本上解决问题。
为此,除扩大过滤面积外(生产2亿~3亿鱼苗,需过滤面积40~50平方米过滤窗)还需将过滤池设计、建造成两个,在孵化不停水的情况下,定期轮换清洗排污后,共同供水。不便排污者可在清洗后用60目乙纶胶丝布做成的长筒形布袋捞出敌害和杂物,始终保持滤水畅通。