1、卵、苗气泡病：当孵化用水较肥、绿藻过多(水呈深绿色)时，在阳光下光合作用造成氧过饱和，或孵化用水进入孵化器之前剧烈撞击造成氧过饱和，都会发生气泡病。得气泡病的鱼卵、幼苗体内、外形成气泡，漂浮水面而死亡。

    防治方法是避免使用深绿色水孵化，由坝下剧烈撞击的水也不能直接用于孵化，需经一昼夜静置后方可使用。一旦发生气泡病，应改变水源或将鱼卵、幼苗移入清水中继续孵化。

    2、水霉病：当水质较肥、水温较低(18℃左右)，或鱼卵受精率不高和幼苗受伤的情况下，鱼卵、幼苗易于感染水霉菌，特别是粘性卵更易发生水霉病。感染水霉菌的鱼卵外周丛生一层水霉菌，状如太阳光芒，幼苗受伤部位同样滋生如旧棉丝的水霉菌。发病时，往往先由未受精卵开始感染，然后向好卵蔓延，使孵化率显著降低。

    该病主要是预防，即尽可能提高受精率和用清洁水体孵化，粘性卵尽可能采用脱粘流水孵化；鱼巢着卵前，特别是重复使用前要经过太阳曝晒或蒸煮，高温杀死水霉孢囊。

    3、敌害：在鱼卵孵化过程中，主要敌害是桡足类(剑水蚤等)、枝角类(水蚤等)、小鱼、小虾类等。