鱼种是养鱼的基础之一。流水养鱼属高密度、高产量的养殖方式，需要大量的鱼种，特别是大规格的鱼种。所以着力抓好鱼种配套是高产、稳产的必备条件。

    对于农家式的流水养鱼和小规模的流水养鱼，由于鱼池面积有限，同时所需的鱼种不多，一般鱼种来源和配套易于解决，随意性也较大；但对于较多流水养鱼池，生产规模较大，则需要鱼种配套。如珠江水产研究所通过4个流水养鱼池饲养草鱼，即将草鱼自小到大分四级饲养，使分级后各鱼池育成规格及所饲养天数基本相符，以达到鱼种配套的目的。